Markus Pflüger studierte Geographie (Diplom, Nebenfach Soziologie) in Saarbrücken, Québec und Metz. Er arbeitete von 2000 bis 2022 als hauptamtlicher Referent für Friedensarbeit bei der Arbeitsgemeinschaft Frieden e.V. Trier und arbeitet seit 2011 bei der Mobilen Beratung gegen Rechtsextremismus Rheinland-Pfalz. Ehrenamtlich engagiert er sich aktuell im Antiatomnetz Trier, als Beirat der Informationsstelle Militarisierung und der Friedensakademie Rheinland-Pfalz sowie beim Arbeitskreis Friedensfähig der AG Frieden und der Deutsche Friedensgesellschaft Vereinigte KriegsdienstgegnerInnen Trier.  Er ist und berät Kriegsdienstverweigerer und ist Trainer für gewaltfreie Aktion und Zivilcourage.